[必看]：万台电脑成合力 网格计算寻找抗非典解药

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“加入网格计算，寻找SARS解药”最近成为了互联网发烧友们的热门话题，因为一个新的、基于网格概念的软件为所有个人电脑用户提供了一次机会，一次尽快找到治疗SARS药物的机会。由加拿大罗斯伯格儿童疾病研究所主持，旅美华裔科学家、耶鲁大学医学院遗传学助理教授许田领导的药物设计优化实验室(D2OL)已经悄悄展开了行动。短短3周的时间内，已经有近6万人通过登陆www.d20l.com，下载相关软� ... S的计算中来。


　　网格计算思想由来已久

　　所谓D2OL，实际上是利用了计算机领域早已闻名的网格思想，简单的说就是将一个庞大的数学计算分解成若干个小块，每一个小块都是一种可能，然后利用网络，将这些小块分别下载到不同的电脑中，这样可以大大提高运算速度。这些个人电脑的计算结果将通过网络汇总，专业的分析软件会根据计算的汇总结果，采取排除法原则，把最终答案确定在某个位置上。

　　实际上这种网格计算的思想由来已久。中国最原始的计算工具算盘进行的运算，也可以说是网格的一种原始表现，不过计算结果的相互沟通不是用网络，而是人与人之间。网格计算最大的优势就在于分散，将需要超级电脑才能进行的计算分给上万台家用个人电脑，甚至仅仅利用这些个人电脑闲置时候的屏幕保护时间进行计算，积少成多，最终解决需要超级电脑才能算出来的庞大数学计算问题。

　　中国个人电脑大有作为

　　其实，D2OL项目早在2002年4月就展开了，不过最初的计算对象并不是SARS，而是埃博拉病毒、炭疽热杆菌和天花。由于从今年3月开始，非典型肺炎在亚洲，尤其是在中国愈演愈烈，作为上海复旦大学学者的许田才提议把计算对象转成SARS病毒。期望能利用大家的力量，对SARS病毒展开排查研究。美国知名的《连线》杂志甚至以《用计算机与SARS赛跑》为头条报道了D2OL的SARS计算项目，文中还一再强调，中国拥有的庞大的个人电脑，势必将成为D2OL的强大计算后盾。

　　许田的所谓药物设计优化实验之所以能够充分利用网格技术，关键还在于生物界长久以来的实验传统，一般常规的情况下都是直接将各类化学物质作用于病原体或与病原体活性密切相关的蛋白质，观察哪些物质能抑制病原体生长。但数以百万计的化学物质实验量是不太可行的，尤其是对SARS这样正在肆虐的疾病，争取时间成为了第一位要素。所以利用网格技术的虚拟分散计算成为了最合适的解决方案。

　　利用分子生物学的筛选原理，我们预先在计算机上对化学物质进行筛选，挑选出少数比较有潜力的物质，然后在实验室中进行有针对性的试验。许田已经在D2OL的主服务器上进行了分类，将SARS病毒的数据与各种化学物质的数据整理好，而参与者只要通过网络连接到服务器上，服务器就会自动一次下载30到50个不同的比对实验进行计算，结算完毕再把结果反馈给主服务器，然后再下载新的比对参数，如此以往，只要加入的电脑越多，实验的进展就越快。而且实验不仅仅停留在网络的虚拟计算上，只要发现某种物质有潜力作为对抗SARS的药物，实验室就会将该物质作用于SARS病毒样本，以观察实际效果。许田教授介绍，目前已经计算出几种比较有希望抗SARS的物质，而且他已经声明，D2OL运算的结果将立即在网上无偿公开。

　　网格计算参与探索外星文明

　　许田的D2OL与目前世界上最大的网格计算相比要小得多，美国伯克利加州大学的SETI研究小组的SETI@home（计算寻找外星文明）是目前参与人数最多的网格项目，从1999年至今已经有447万台计算机在日夜不停的参与着，这是20台价值千万美元的超级电脑所能达到的计算极限。

　　不过随着个人电脑性能的快速提升，网格计算的能量越来越大，即便没有百万人的参与，几万人也可以造就几台深蓝电脑的实力。如果参与许田D2OL运算的人如果能像计算寻找外星文明的那么多，也许真的会在很短的时间内找寻到抗SARS的物质。（人民网）